生物技术系下设动物学、生化与分子生物学、生物检测等3个教研室。2004年首次开设生物技术本科专业。2010年，生物技术专业首批入选“湖北省战略产业人才培养计划”；2012年，获批湖北省高校“生物技术专业综合改革试点项目”；2018年，建立桂建芳院士科技创新平台，聘请桂建芳院士引领专业建设；2019年，生物技术专业入选湖北省一流本科专业建设点，生物技术专业应用型人才培养教学团队获省级教学团队称号；2021年，入选国家级一流本科专业建设点；2023年，“生物技术专业实践教学体系创新与应用”获省级教学成果二等奖。
生物技术系坚持“立足武汉、面向湖北、辐射全国”的人才培养目标定位，培养德智体美劳全面发展，具有社会责任感、良好职业道德、团队合作精神和较强实践能力，掌握生物科学与技术等相关学科专业知识，能在生物遗传资源保护与创新、生态修复、分子检测、生物技术产品开发等领域从事产品开发、技术管理、质量控制、安全生产等工作的高素质应用型人才。办学以来，生物技术专业以国家生物产业基地武汉光谷生物城建设和产业人才需求为导向，以培养高素质、创新型、应用性人才为己任，以学院拥有的多个科研平台为依托，建立了校企协同“3+1”培养的应用型人才培养模式，采取学生入校后“三段式”培养和管理的举措，人才培养成效显著。
生物技术系现有专业教师25人，其中教授9人，副教授8人，博士生导师4人，硕士生导师15人，二级教授2人，享受国家级政府津贴专家2人、省突出贡献青年专家1人、市学科带头人3人，专任教师Sara Platto副教授获2021年中国政府友谊奖。近3年来主持国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目等省级以上项目30余项，发表科研论文100多篇，获省部级科技奖励3项。